Подходящи "кандидат гени" и мета-анализ при идентифицирането на рискови алели

През последните 15 години се наблюдава експоненциален растеж в броя на проучвания за идентифициране на кандидат-гени за възникването на коронарна болест на сърцето. Въпреки това, липсата на възпроизводимост на данните на алели на кандидат гени и тяхната връзка с риск от коронарна болест свиня съмнение сред епидемиологични генетиката. Повечето от тях все още се отнася до изследвания някакви единични едно заместване на бази, които могат да бъдат просто полиморфизъм и не означават нищо. Понастоящем тези изследвания са сведени до така наречения мета-анализ, анализ на специално нуклеотидна замяна в много популации. През последните години, публикува няколко мета-анализи (табл. 1).

Таблица 1

Списъкът на ген варианти с публикуваните резултати от мета-анализа на риска от коронарна болест на сърцето. В няколко извършени анализи на същия ген вариант показва само позоваване на последните

ген (Варианти)	генотип, свързана с риск	Броят на изследвания (брой случай)	Ефект (95% CI)	връзка
AT1R (1166A >C)	C +	27 (10,180)	1,13 (1,04- 1,23)	Ntzani и др., 2007
MMRZ (5A / 6А)	5A +	8 (3655)	1,26 (1,11- 1,4)	Abilleira и др., 2006
ММР9 (1562S >Т)	T +	5 (4817)	1,11 (1- 1,3)	Abilleira и др., 2006
АроЕ &епсилон-2, 3, 4,	2+ 4+	121 (37,850)	0,8 (0,70- 0,90) 1,06 (0,99- 1,13)	Бенет и др., 2007
LTA (10G >А)	A +	7 (10,996)	1,09 (1,02- 1,16)	Кларк и др., 2006
LPL (N291S)	S +	21 (1203)	1,48 (1,09- 2)	Ху и др., 2006
AGT (T174M) (M235T)	М + T +	43 (13478)	1,07 (0,93- 1,22) 1,11 (1,03- 1,19)	Xu и др .. 2007
F5 (1691G >А) F7 (10976G >А) F2 (20210G >А) PAI1 (4G / 5G) GP1A (807C >Т) GP1BA (5T >C) GP3A (1565 С >Т)	A + A + A + 5G + T + C + T +	60 (15,704) 24 (7444) 40 (11.625) 37 (11,763) 15 (6414) 14 (6652) 43 (16,984)	1,17 (1,08-1,28) 0,97 (0,91-1,04) 1,31 (1,12-1,52) 1.06 (1,02-1,1) 1,02 (0,97-1,08) 1,05 (0,96-1,13) 1,03 (0,98-1,07)	Йе и др., 2006
IL-6 (174 g >C)	C +	8 (4799)	1,12 (0,97- 1,29)	Сие и др., 2006
F13 (V34L)	L +	12 (8743)	0,79 (0,66- 0,93)	Shafey и др., 2007

Един от най-изследваните гени, кодиращи плазма аполипопротеин Е, който се нарича АроЕ. Най-често срещаният АроЕ-алел - E3. Има и други две опции - Е4 и E2 (разпространение на тези алели сред хората в Европа е 0.15 и 0.07, съответно). Промени в ДНК на генната последователност засягат двете заредени амино киселини, които влияят клирънс плазмените протеини и холестерол богати липопротеин провеждане този протеин. (. Фигура 1) Като следствие от има асоциация на алел данни с нивото на плазмените липиди (Е2 алел намалява тяхната концентрация и Е4 - увеличава), това води до факта, че няколко алели Е2 намалява риска от коронарна болест на сърцето и увеличава Е4 значително.

Мета-анализ на ефекта на АроЕ генотипа върху плазмените липиди и риска от развитие на коронарно сърдечно заболяване. За всяко изследване, контролната група се състои от непушачи с HCV генотип 3 3. Променено (с разрешение): Bennet A.M., Di Angelantonio Е., Zheng Y. и сътр. Асоциация на аполипопротеин Е генотипове с нивата на липидите и коронарен риск // JAMA. - 2007 - Н. 298. - П. 1300-11.

Фиг. 1. Мета-анализ на ефекта на АроЕ генотипа върху плазмените липиди и риска от развитие на коронарно сърдечно заболяване. За всяко изследване, контролната група се състои от непушачите с HCV генотип 3 месец март.

Променено (с разрешение): Bennet A.M., Di Angelantonio Е., Zheng Y. и сътр. Асоциация на аполипопротеин Е генотипове с нивата на липидите и коронарен риск // JAMA. - 2007 - Н. 298. - П. 1300-11.

Силвия Приори Г., Карло Наполитано Стив Е. Хъмфрис и Джеймс Скипуорт

Генетични аспекти на сърдечно-съдови заболявания

Споделяне в социалните мрежи:

сроден